Florian Dumourier (CR4C Roanne) puis Jérémy Defaye (SCO Dijon) sont les premiers attaquants du jour sur les routes très ensoleillées (30°C) de Savoie, mais la première échappée sérieuse se dégage au kilomètre 19 avec quatre coureurs : Marc Goos, Florian Stork (Development Team Sunweb), Franck Bonnamour (Fortuneo-Vital Concept) et Marcel Neuhauser (Team Felbermayr-Simplon Wels). Un contre de six hommes comprenant Johannes Schinnagel (Team Felbermayr-Simplon Wels), Benoît Cosnefroy (Chambéry Cyclisme Formation), Jan Reynaerts, Gianni Marchand (Cibel-Cebon), Pablo Torres Muino (Burgos-BH) et Gian Friesecke (Team Vorarlberg) revient rapidement sur la tête de course pour former une importante échappée de dix unités.

Le peloton laisse longtemps filer. La formation Cibel-Cebon du maillot jaune Jimmy Janssens, qui a envoyé deux coureurs aux avant-postes, n’assume pas la poursuite. D’autant que le mieux placé des dix coureurs dans l’échappée n’est autre que Gianni Marchand, de la Cibel-Cebon. La Lotto-Soudal U23 décide de prendre les choses en main. Au Km 70, l’écart est de 3’20 ». Gianni Marchand est alors leader virtuel de l’épreuve. Les choses sérieuses débutent dans le Col de Tamié. Reynaerts, Goos et Stork y sont tour à tour lâchés du groupe de tête alors que Frédéric Brun (Bourg-en-Bresse Ain Cyclisme) en profite pour sortir du peloton et revenir sur l’avant. L’ancien professionnel se sent pousser des ailes et s’en va seul dans le Col du Marais. Il creuse rapidement l’écart sur ses anciens compagnons d’échappée et compte même 1’40 » d’avance sur le groupe de contre et 5’00 » sur le peloton avant d’être victime de crampes à 40 kilomètres de l’arrivée. Il doit s’arrêter et voit ses poursuivants le reprendre.

C’est donc huit hommes qui se présentent ensemble au pied du Mont Saxonnex, juge de paix de cette 2e étape, mais avec seulement 30″ d’avance sur le peloton. Ils sont vite repris et débordés par Egan Bernal (Androni-Sidermec-Bottecchia). Le Colombien place une énorme accélération dans les pentes les plus difficiles et passe au sommet seul en tête avec 46″ d’avance sur le premier contre-attaquant, Victor Lafay (Bourg-en-Bresse Ain Cyclisme). Egan Bernal ne sera plus jamais revu et s’en va décrocher la victoire d’étape après un joli numéro dans le final. Victor Lafay coupe la ligne en deuxième position alors que le Suisse Patrick Schelling (Team Vorarlberg) complète le podium. Présent dans le deuxième contre, le Belge Jimmy Janssens parvient à conserver sa tunique jaune.